Proc. Nat. Acad. Sci. | 靶标结构感知的生成式 AI 模型助力 PROTAC 与配体分子从头设计

传统 PROTAC 设计多局限于在已知配体间优化连接子,难以突破既有分子骨架,尤其对缺乏明确结合口袋的「难成药」靶标很难实现理性设计 … 为解决这一瓶颈,本研究开发了 DeepDegradome—— 首个基于 FBDD 将小分子配体与 PROTAC 设计统一于结构感知框架的 AI 生成模型 … 课题组目前已经形成从 PROTAC 数据库构建、从头分子生成、连接子生成、降解药效评价、可合成性评价、靶向 EGFR 的 PROTAC 分 ADMET 预测等系列工作,形成完善的 PROTAC 药物设计计算方法,为靶向难成药靶标的降解剂类药物设计提供了系统的技术支持。

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