研究人员以真核来源的紧凑型 RNA 引导核酸酶 Fanzor2(Fz2)为对象,将同源蛋白发现、ωRNA 支架工程与一种名为 EvoMax 的稀疏数据模型引导蛋白进化方法相结合。他们首先从超过 1,600 个候选中寻找具有潜力的真核 Fz2 同源蛋白,然后优化 ωRNA 支架,进一步开发 EvoMax,在只有数百个已测突变数据的情况下引导 Fz2 迭代进化,并最终评价其内源基因编辑能力和体内应用潜力。蛋白优化方面,研究人员汇集 209 个具有实验活性数据的单点突变,以 BLOSUM62 编码的 GPR 建立经验适应度模型,并将其与 ESM-2 提供的进化先验以及 ESM-IF 提供的结构兼容性评分结合形成 EvoMax。

